Silnie zagrożone gatunki pingwinów to:
- Pingwin skałkowaty północny: Krytycznie zagrożony; ok. 4000 par legowych.
- Pingwin afrykański: Zagrożony; ok. 19 000 par legowych.
- Pingwin hakurowaty: Zagrożony; ok. 1,2 mln par legowych.
- Pingwin z Snares: Wrażliwy; ok. 30 000 par legowych.
- Pingwin z Fiordland: Wrażliwy; ok. 150 000 par legowych.
Główne zagrożenia to nadmierne rybołówstwo, zmiany klimatyczne, utrata siedliska, rybołówstwo komercyjne i gatunki obce.