Trudno wskazać jedno najrzadsze zwierzę w Hiszpanii, bo nie ma kompletnej listy, a niektóre gatunki są trudne do zaobserwowania. Jednak kilka kandydatów wyróżnia się:
* Ryś iberski: Z około 100 osobnikami, ten krytycznie zagrożony ssak to jeden z najrzadszych na świecie.
* Orzeł królewski hiszpański: Zagrożony utratą siedliska i bractwem, populacja jest mała.
* Wydra iberska: Mały, półwodny ssak występujący tylko na Półwyspie Pyrenejskim, krytycznie zagrożony zanieczyszczeniem i degradacją siedliska.
* Foka mnicha śródziemnomorskiego: Krytycznie zagrożona, rzadko widywana w wodach hiszpańskich, z kilkoma osobnikami w Morzu Śródziemnym.
* Jaszczurka ścienna iberska: Uważana za wrażliwą przez niszczenie siedlisk i gatunki inwazyjne.
Wszystkie te zwierzęta stoją przed poważnymi zagrożeniami, co czyni wysiłki ochronne kluczowymi dla ich przetrwania.