Lemury bambusowe, jak większość lemurów, mają wrodzonych wrogów w naturalnym siedlisku. Najczęstsze to:
- Fossa: Duże, kotopodobne ssaki – najsilniejszy drapieżnik Madagaskaru. Polują na lemury bambusowe.
- Jastrzębie i sowy: Drapieżne ptaki polujące na małe ssaki.
- Węże: Niektóre gatunki na Madagaskarze polują na lemury.
- Dzikie koty: Gatunki allochtonowe (koty dziko żyjące) to poważne zagrożenie.
Ważne: Utrata i degradacja siedlisk to też ogromne zagrożenie, czyniąc lemury wrażliwymi na drapieżnictwo i inne niebezpieczeństwa.