Jednak niektóre nietoperze, które są krytycznie zagrożone i napotykają wyjątkowo wysokie ryzyko wyginięcia, obejmują:
* Nietoperz owocowy Mariana (Pteropus mariannus): Gatunek ten jest endemiczny dla Wysp Mariany i stoi w obliczu ekstremalnej utraty siedlisk i presji polowania.
* Jamajski nietoperz owocowy (Artibeus jamaicensis): Ten nietoperz jest uważany za krytycznie zagrożony z powodu zniszczenia siedlisk i gatunków inwazyjnych.
* Nietoperz owocowy Rodrigues (Pteropus rodricensis): Gatunek ten jest endemiczny dla wyspy Rodrigues i poważnie wpłynął na utratę siedlisk i wprowadzenie inwazyjnych drapieżników.
* Batbebee Bat (Craseonycteris thonglongyai): Ten mały nietoperz, znaleziony w Myanmarze, jest uważany za krytycznie zagrożony z powodu utraty siedlisk i nielegalnych pułapek.
* Kitti's Hog-nosed Bat (Craseonycteris thonglongyai): Ten nietoperz, znaleziony w Tajlandii, jest najmniejszym gatunkiem nietoperzy i jest krytycznie zagrożony z powodu utraty siedlisk i zakłóceń ludzkich.
To tylko kilka przykładów. Wiele innych gatunków nietoperzy stoi w obliczu zagrożeń, takich jak utrata siedlisk, zmiany klimatu i choroby.
Należy zauważyć, że wysiłki ochrony są kluczowe dla ochrony wszystkich gatunków nietoperzy i ich istotnej roli w ekosystemach.