Jeleń bielooki, jak wszystkie ssaki, pobiera tlen przez oddychanie. Powietrze wpada przez nozdrza, przechodzi przez jamy nosowe i trąbkę kręgową do płuc.
W płucach tlen przenika przez drobne pęcherzyki płućne (alweole) do otaczających je naczyńków włosowatych, a dwutlenek węgla w przeciwnym kierunku, by zostać wydechniętym. Ta wymiana gazowa utrzymuje krew jelnia nasyconą tlenem i usuwa gazy odpadowe.