Królestwo Monera obejmuje organizmy prokariotyczne, podzielone głównie na bakterie i archabakterie.
Bakterie
Eubakterie obejmują znane grupy, takie jak cyjanobakterie (glony sinice-zielone), bakterie Gram-dodatnie jak Laktobacylus i Staphylococcus, oraz Gram-ujemne, np. Escherichia coli i Pseudomonas.
Archabakterie kwitną w skrajnych środowiskach i obejmują metanogeny produkujące metan, skrajne halofile w silnie słonych obszarach, skrajne termofile w bardzo gorących środowiskach i acidofile rosnące w mocno kwasowych warunkach.
Cyjanobakterie
Cyjanobakterie to fototrofowe prokarioty wykonujące fotosyntezę oksydacyjną. Występują w środowiskach słodkowodnych i morskich, a niektóre gatunki potrafią fiksować azot atmosferyczny, grając kluczową rolę w cyklach składników odżywczych.