Istnieje kilka różnych modeli specjacji, z których każdy opisuje inny sposób, w jaki mogą pojawić się nowe gatunki. Najczęstszy model specjacji nazywa się Specjacja alopatryczna , który występuje, gdy dwie populacje tego samego gatunku stają się od siebie izolowane geograficznie i ewoluują niezależnie, ostatecznie stając się dwoma odrębnymi gatunkami. Specjacja allopatryczna może być spowodowana różnymi czynnikami, takimi jak tworzenie zasięgu górskiego, wysuszenie jeziora lub rozdzielenie mas lądowych nad rzeką lub oceanem.
Kolejny model specjacji nazywa się Sympatric Specation , który występuje, gdy dwie populacje tego samego gatunku ewoluują niezależnie w tym samym położeniu geograficznym, bez żadnej fizycznej bariery między nimi. Specjacja sympatyczna może wystąpić z powodu różnych mechanizmów, takich jak dobór naturalny działający na różne cechy w tej samej populacji, ewolucję izolacji rozrodczej lub występowanie poliploidii, stan, w którym organizm ma więcej niż dwa kompletne zestawy chromosomów.
Proces specjacji może być złożony, a specyficzne mechanizmy prowadzące do utworzenia nowych gatunków są nadal badane i dyskutowane przez naukowców.