Region góry Kanchenjunga obfituje w bioróżnorodność. Znajdują się tam:
Ssaki: leopard śnieżny, niedźwiedź himalajski, owce niebieskie, tahr himalajski, panda czerwona, jeleń moschusowy.
Ptaki: monal himalajski, kurka krewna, kuropatwa śnieżna, lammergejer, sup himalajski, orzeł złoty.
Gady: żmija himalajska, kobra królewska, jaszczurka tybetańska.
Płazy: triton himalajski, żaba tybetańska.
Bezkręgowce: chrząszcz goliat, pszczela himalajska, pająk pawik, wielonogi, tysiączniki.
Występowanie i rozmieszczenie zależą od wysokości n.p.m., siedliska i pory roku.