Jelenie moschusowe są polowane głównie dla mosczu – wysoce cenionej substancji w przemyśle perfumeryjnym. Samce produkują moscz do oznaczania terytorium i przyciągania partnerów. Jego intensywny, trwały zapach służy jako fixatyw w perfumach, pomagając innym nutom trwać dłużej.
Braconnictwo na moscz stanowi poważne zagrożenie dla populacji. Ta okrutna i nieuznawalna praktyka niszczy ekosystemy i pchnęła gatunek na skrań zagrożenia.
Poza mosczem, jelenie moschusowe są też polowane dla mięsa i futra w niektórych regionach, choć te presje są mniejsze niż popyt na moscz.