Ludzkie aktywności to główna przyczyna śmierci lamantynów. Należą do nich: bezpośrednie polowanie, przypadkowe splątanie w sieciach rybnych, zderzenia z łodziami i śrubami napędowymi, utrata i degradacja siedlisk przez rozwój obszarów przybrzeżnych, zanieczyszczenie wody pestycydami, nawozami, ropą i ściekami. Zmiany klimatyczne również szkodzą lamantynom, zakłócając podstawę pokarmową i zwiększając wrażliwość na choroby.