Niszczenie siedlisk to jedno z największych zagrożeń dla bioróżnorodności na świecie. Dwie najbardziej istotne przyczyny to:
1. Rolnictwo
Rolnictwo to wiodąca przyczyna niszczenia siedlisk. W miarę wzrostu populacji ludzkiej potrzeba więcej ziemi do produkcji żywności. To często oznacza wycinanie lasów, bagien i innych naturalnych siedlisk pod pola uprawne.
2. Rozwój miejski
W miarę ekspansji miast, one często ingerują w naturalne siedliska. To może skutkować niszczeniem lasów, bagien i innych obszarów naturalnych na rzecz mieszkań, infrastruktury i rozwoju komercyjnym.
Oba – rolnictwo i urbanizacja – wypierają nieliczne gatunki i fragmentują krajobrazy, od których zależą dla przetrwania.