Konie, jak większość zwierząt na naszej planecie, mają dwa chromosomy. Te chromosomy rządzą każdym aspektem bytu konia i stanowią genetyczną mapę zwierzęcia i jego cech. Chromosom X jest większy od chromosomu Y i dlatego może przenosić więcej informacji lub markerów. To te markery kontrolują atrybuty zwierzęcia. Liczba cech polega na markerach z obu chromosomów X i Y, ale zgodnie z artykułem R. Soutara, wielkość serca wydaje się być funkcją samego chromosomu X.
Wielkość serca
Pełnokrwiste konie zazwyczaj mają serce ważące około 7 funtów (ok. 3,2 kg). Niektórzy wybitni biegacze mieli znacznie większe serca, często ważące aż 14 funtów (6,3 kg), a w przypadku słynnego Secretariatu – fenomentalne 25 funtów (11,3 kg). Spośród wielu czynników rządących wydolnością konia wyścigowego, wielkość serca jest najbardziej istotna.
Marianna Haun, rzeczniczka grupy genetyków i kardiologów, proponuje, że kodowanie genetyczne dla dużego serca pochodzi z chromosomu X, i nazywa ten stan czynnikiem X (X factor).
Samice mają dwa chromosomy X, podczas gdy samce mają jeden X i jeden Y. Klaczka (samica konia) ma zatem dwukrotnie większą szansę na otrzymanie markera dużego serca. Ponieważ jeden z chromosomów X u klaczki jest zazwyczaj dominujący, jest możliwe, by była nośnicą cechy dużego serca, nie mając go sama. Jej potomstwo jednak prawdopodobnie będzie miało duże serca.
Dyspozycja (temperament)
Według Andrea Laycock Mattson, dyspozycja konia prawdopodobnie jest wpływana przez chromosom X. Twierdzi, że trenowalność i ogólna inteligencja są wpływane przez ten chromosom samotnie. Przez domestykację konie służą człowiekowi w licznych sposób. Są używane jako zwierzęta ciągowe do wozów, pługów i innych ciężkich ładunków, do goniowania bydła i paszenia innych zwierząt. Konie są używane w sportach takich jak polo i wyścigi, i rozrywają nas w cyrkach. Zdolność koni do reagowania na trening i chęci do pracy jest kluczowa dla każdej z wielu funkcji, jakie pełnią dla człowieka. Ponieważ te cechy mogą być rządzone przez chromosom X, hodowcy i trenerzy koni są zainteresowani dowiedzeniem się, jak dyspozycja zwierzęcia jest dziedziczona genetycznie.
Hemofilia A
Ta choroba układu krwionośnego, przy której koń łatwo krwawi, jest dziedziczona przez chromosom X u wielu ras, w tym pełnokrwistych, quarter horse i arabskich. Objawy są zauważalne po dużym wysiłku, np. wyścigu konnym, gdy zwierzę zaczyna swobodnie krwawić z nosa. Hemofilia A u koni jest uważana za jedną z ciężkich dziedzicznych koagulopatii.