Drapieżniki: Węgorze amerykańskie są ofiarami ptaków (rybaczy, orłów, czapli), ryb (okonia piaszczystego, błękita, szczupaka) i ssaków (wydry, szopowe, niedźwiedzie).
Pasożyty: Mogą gościć nicienie, trematody i taśmice.
Choroby: Infekcje bakteryjne, wirusowe i grzybowe mogą dotyczyć węgorzy amerykańskich.
Strata siedliska: Degradacja strumieni, rzek, ujść i wód przybrzeżnych zagraża ich cyklowi życiowym.
Przełowienie: Węgorze łowione na jedzenie, przynęty i handel zwierzętami, co może zmniejszać populacje.