Rekiny cytrynowe nie zaliczają się do najbardziej agresywnych gatunków, ale zdarzało się, by gryzły ludzi. Większość incydentów jest prowokowana – przy manipulowaniu, harpunowaniu lub drażnieniu rekinem przez ludzi.
Odnotowano też niewielką liczbę ataków nieprowokowanych, choć pozostają one rzadkie. Rekiny cytrynowe zamieszkują płytkie wody przybrzeżne, rośliny manglowe i zatoczki, co zwiększa szansę na sporadyczny kontakt z ludźmi.
Jak przy każdym dużym drapieżniku dzikim, zaleca się ostrożność przy pływaniu lub nurkowaniu w rejonach występowania rekinów cytrynowych.