Naturalni drapieżnicy
Delfiny rzeczne zagrażają im większe ryby, krokodyle, kajmany, jaguary i inne drapieżniki wodne, zwłaszcza gdy są młode lub osłabione.
Wpływ ludzki
Ludzie to największe zagrożenie. Ponadmierne łowstwo i połowy uboczne, niszczenie siedlisk przez zapory i zanieczyszczenia, nielegalne polowanie – wszystko to zagraża delfinom Rzecznym. Gatunki jak delfin amazoński i delfin gangeski są szczególnie wrażliwe.
Ochrona delfinów rzecznych wymaga walki ze złożonymi, splatanymi zagrożeniami.