Węgorze słodkowodne: Węgorze słodkowodne występują w różnych siedliskach, w tym w rzekach, strumieniach, jeziorach i stawach. Niektóre pospolite gatunki węgorzy słodkowodnych obejmują węgorz amerykański (Anguilla rostrata), który zamieszkuje systemy słodkowodne wzdłuż atlantyckiego wybrzeża Ameryki Północnej, oraz węgorz europejski (Anguilla anguilla), który występuje w siedliskach słodkowodnych w całej Europie. Węgorze słodkowodne żyją zazwyczaj na płytkich, porośniętych roślinnością obszarach o błotnistym lub piaszczystym dnie. Często można je znaleźć ukryte pod kamieniami, kłodami lub innymi gruzami.
Węgorze morskie: Węgorze morskie występują w różnorodnych siedliskach, w tym w rafach koralowych, skalistych wybrzeżach, piaszczystych plażach i środowiskach głębinowych. Niektóre pospolite gatunki węgorzy morskich obejmują murenę (Muraenidae), którą można spotkać na rafach koralowych i w środowiskach skalistych, oraz węgorza kongera (Conger conger), który występuje na piaszczystych i błotnistych dnach wzdłuż wybrzeży Atlantyku i Pacyfiku . Węgorze morskie mogą żyć zarówno w płytkich, jak i głębokich wodach i często można je spotkać w szczelinach, jaskiniach lub pod skałami.
Węgorze diadromiczne: Węgorze diadromiczne spędzają część swojego cyklu życiowego w wodzie słodkiej, a część w wodzie słonej. Gatunki te zazwyczaj rozmnażają się w słodkiej wodzie, a młode osobniki migrują do oceanu, gdzie rosną i dojrzewają. Jako dorosłe osobniki wracają do wód słodkich, aby się rozmnażać. Typowe gatunki węgorzy diadromicznych obejmują węgorza amerykańskiego i węgorza europejskiego.