Filipiny to dom dla różnorodnych rodzimych ryb słodkowodnych, w tym kilku gatunków kardzi. Pstrąga tęczowa została też wprowadzona do celów komercyjnych i rekreacyjnych.
Rodzimie gatunki to m.in.
- Kardział plamisty (Puntius binotatus): w rzekach, strumieniach i jeziorach górskich.
- Kardział rodzimy (Puntius sp.): znany lokalnie jako "dalag", w górskich strumieniach.
- Kardział z Mindoro (Puntius sealei): endemiczny dla wyspy Mindoro.
- Kardział z Palawan (Puntius palata): w rzekach i strumieniach Palawan.
- Kardział malabarski czerwony (Puntius filamentosus): wprowadzony, w wodach słodkich.
- Kardział czerwonoogonowy (Puntius erythromicron): rodzimy w rzekach i strumieniach Filipin.
Inne rodzimie gatunki słodkowodne to: gurami złoty, nóżownik plamisty, gurami olbrzymi, i dzikie populacje rybek aniołowych.