Mimo niewielkich rozmiarów, krótkoogonowy szyńszył ma w naturze wielu drapieżników. Oto najważniejsi:
Ptaki drapieżne: Jastrzęby, sowy, orły – ulubieni polujący na szyńszyły. Łatwo chwytają je z ziemi, a nawet z drzew.
Lisy: Lisy rdzawe i szare – zwinne, sprawne polujące, poważne zagrożenie.
Kojoty, w obszarach wspólnych z szyńszyłami, też je polują.
Tchórzy i inne ciemienniki: Mniejsze drapieżniki: tchórzy,borsuki, skunksy – zagrożenie zwłaszcza dla młodych i osłabionych osobników.
Węże: Niektóre gatunki, zwłaszcze dobre wspinacze, potrafią polować na szyńszyły.
Większe ssaki: Domowe koty i psy, a nawet pumy i lwy górskie – rzadsze, ale możliwe spotkania.
Konkretny zestaw drapieżników zależy od lokalizacji geograficznej i lokalnego ekosystemu.