Zagrożone rośliny istniały od początku życia na Ziemi. Procesy naturalne – zmiany klimatu, zdarzenia geologiczne, konkurencja między gatunkami – spowodowały wyginiecie wielu gatunków roślin w czasie.
Jednak działalność ludzka – wycinka lasów, niszczenie siedlisk, zanieczyszczenie, zmiany klimatu – przyspieszyła tempo wyginania roślin. To przyspieszenie doprowadziło do obecnego kryzysu zagrożonych gatunków roślin na świecie.