Pestycydy stosuje się do zwalczenia szkodników niszczących uprawy, zwierzynę hodowlaną i zdrowie ludzi. Najczęściej celowane grupy to:
Owady: Mszyce, chrząszcze, gąsienice, muchy, koniki, świerszcze, komary, termity – niszczą plony i roznoszą choroby.
Chwasty: Pchła pospolita, mlecz, komosa, kwiatowcowate – konkurują z uprawami o wodę, składniki, światło.
Kręgowce: Gryzoń, ptaki, ssaki jak jeleń i króliki – zjadają lub zanieczyszczają pożywkę, niszczą konstrukcje.
Grzyby: Rdze, mączniaki, parzenia – obniżają plony, mogą rozwijać odporność.
Bakterie: Zaraza bakteryjna, więdnięcie – szybko rozprzestrzeniają się, powodują duże straty.
Nematody: Mikroskopijne nicienie ataku korzenie, obniżając pobór wody i składników.
Przyczyńcy: Pajęczyny roztocza, roztocza szerokie – zarazają rośliny i zwierzęta, szkodzą, roznoszą choroby.
Mięczaki: Ślimaki i ślimaki nagie – jedzą liście, łodygi, owoce, sprzyjają grzybom.
Szczegółowe cele zależą od regionu, klimatu, praktyk rolniczych i wzorców odporności.