Jaszczurki to jedna z najbardziej zróżnicowanych grup płazów – znanych jest ponad 4675 gatunków. Samą Kalifornię zamieszkuje 47 gatunków, a z podgatunkami liczba rośnie do 69. Większość to gatunki rodzimye, z wyjątkiem czterech wprowadzonych.
Rodzina Phrynosomatidae – jaszczurki kolczaste
W Kalifornii występuje 18 gatunków z tej rodziny. Jaszczurka zebrowa (western zebra-tailed lizard) ma charakterystyczny czarno-biały ogon. Jaszczurka Mearnsa występuje tylko w małym rejonie Południowej Kalifornii. Do rodzimego gatunków należą: jaszczurka Blainville'a, krótkoroga pygmejska, płaskooka i pustynna jaszczurka rogata. Jaszczurki kolczaste: zwyczajna szałwiożercza, pustynna kolczasta, zachodnia ogrodowa, granitowa kolczasta i żółtogrzbietata kolczasta. Inne rodzimce: jaszczurka doliny Coachella, pustynia Colorado i Mojave z palcami owłosionymi. Również: długooka pędzlasta, Baja California pędzlasta, drzewna z Colorado i zwyczajna plamista bocznie.
Rodzina Anguidae – jaszczurki aligatorowe
Członkowie tej rodziny nazywane są jaszczurkami aligatorowymi z powodu kształtu ciała. Północna jaszczurka aligatorowa ma 4 podgatunki w północnej części stanu. Południowa – 3 podgatunki, głównie na zachodzie. Jaszczurka aligatorowa Panamint występuje tylko w jednym małym rejonie na wschodzie.
Rodzina Xantusiidae – jaszczurki nocne
6 gatunków z tej rodziny żyje w stanie, w tym jaszczurka nocna piaskowcowa i granitowa. Obie są małe, bladoobarwione z ciemnymi plamami. Dwa podgatunki jaszczurki nocnej wyspowej występują na wyspach przy południowo-zachodnim wybrzeżu. Inne: jaszczurka nocna Sierra, pustynna i Baja California.
Rodziny Scincidae i Gekkonidae – skinki i gejony
Dwa gatunki skinków (Scincidae), w tym 4 podgatunki skinka Gilberta. Są małe, kudłate, z gładką, błyszczącą skórą. Zachodni skink ma 2 podgatunki i jest szczupły. W stanie żyje 5 gatunków gejonów, 2 to gatunki wprowadzone: gejkon śródziemnomorski i mauretański – oba nieorodowe, żyjące w naturze. Inne rodzimce: gejkon Switaka, zachodni paskowany i palcowaty.
Rodziny Crotaphytidae i Teiidae
Crotaphytidae to jaszczurki opasane lub leopardowe. Wielkopolska i Baja California jaszczurka opasana mają nazwy od ciemnych pasów na szyi. Nazwane od ciemnych plam i paskowanego ogona, 3 gatunki jaszczurki leopardowej: tuporyła, długonosa i Copea. Dwa gatunki z rodziny Teiidae (świstaki): Belding pomarańczowogardłowy i 3 podgatunki tygrysiego świstaka.
Inne gatunki
Pozostałe 6 jaszczurek to 2 gatunki inwazyjne. Największy gatunek w Kalifornii to jedyny jadowity płaz w stanie – heloderma zębatka (Gila monster), dorastająca do 30 cm. Dwa gatunki z rodziny iguany: zwyczajny chuckwalla i północny legwan pustynny. Kalifornińska jaszczurka beznoga w ogóle nie ma kończyn i przypomina węża. Kameleon Jacksona z żółtym grzywcem i włoska jaszczurka ścienna to gatunki wprowadzone.