Jaszczurka Gila stoi przed kilkoma zagrożeniami, które przyczyniły się do jej zagrożonego statusu.
Nielegalny handel zwierzętami domowymi
Jeden z głównych czynników to nielegalny handel zwierzętami domowymi. Jaszczurki Gila są bardzo poszukiwane i sprzedawane za tysiące dolarów na czarnym rynku, mimo że w niektórych kulturach rdzennych są czczone.
Strata siedliska
Urbanizacja i działalność ludzka, takie jak rozwój mieszkalny i komercyjny, zakłócają i niszczą naturalne siedliska jaszczurek Gila. Wymagają one specyficznych warunków terenu, takich jak skałkowate pustynie.
Niezrównoważone zbieranie
Niektórzy ludzie łapią dzikie jaszczurki Gila dla badań naukowych, co może napiąć populacje, jeśli robione niezrównoważonie lub bez kontroli. Dodatkowo, zbieranie przez osoby biorące więcej niż dopuszczają przepisy łowieckie i ochronne szkodzi populacjom dzikim.