Wyginięcie wiewiórki rudzionki istotnie wpłynęłoby na ekosystemy leśne, w których odgrywa kluczową rolę.
Rozsiew nasion i łańcuchy pokarmowe
Wiewiórki rudzionki magazynują nasiona i orzechy, przyczyniając się do odnowy lasów i bioróżnorodności. Ich utrata usunąłaby ten mechanizm rozsiewu i zakłóciłoby populacje drapieżników, które na nich polują.
Konkurencja i wartość kulturowa
Gdzie wiewiórki rudzionki i szare współistnieją, rudzionki często wygrywają konkurencję o zasoby. Bez rudzinek populacje szarych mogłyby się rozszerzyć i wypierać inne gatunki rodzimie. Strata niosłaby też konsekwencje kulturowe i estetyczne, w tym wpływ na ekoturystykę i obserwację przyrody.