Masowe wyginięcia mogą nastąpić bez uderzeń asteroid czy broni jądrowych. Kilka procesów naturalnych i ludzkich może napędzać dużą skalę gatunków.
Zmiany klimatu
Gwałtowne i surowie zmiany klimatu Ziemi mogą prowadzić do masowego wyginięcia. Ekstremalne przesunięcia temperatur, zmiany wzorców opadów i prądów morskich mogą zakłócić ekosystemy i utrudnić adaptację. Np. wyginiecie permsko-triasowe („Wielkie Umieranie”) ok. 252 mln lat temu prawdopodobnie wywołano intensywnym ociepleniem i powiązanymi zmianami klimatu.
Strata i niszczenie siedlisk
Powszechna strata siedlisk może zdestruować całe ekosystemy. Gdy naturalne siedliska czyszczone są pod rozwój, rolnictwo, ściągnięcie drzew lub inne ludzkie czynności, gatunki tracą kluczowe zasoby: pożywienie, schronienie, miejsca rozmnażania. To prowadzi do spadku populacji i wzrostu ryzyka wyginięcia. Zniszczenie lasów deszczowych tropikalnych istotnie przyczyniło się do zagrożenia nielicznych gatunków roślin i zwierząt.
Prze-polowanie i prze-rybołówstwo
Niezrównoważone polowanie i rybołówstwo może szybko wyczerpać populacje i pchnąć gatunki ku wyginięciu. Przeeksploatacja dla pożywienia, futra, medycyny lub innych celów może uniemożliwić gatunkom rozmnażanie i samoutrzymanie. Prze-polowanie górali pasażerów doprowadziło do ich wyginięcia na początku XX w., a neregulowane rybołówstwo przyczyniło się do spadku różnych gatunków ryb.
Zanieczyszczenia i toksyny
Wrzucanie zanieczyszczeń i substancji toksycznych do środowiska może szkodzić przyrodzie i ekosystemom. Chemikalia przemysłowe, pestycydy, plastik, metale ciężkie mogą wpadać do łańcuchów pokarmowych i negatywnie wpływać na zdrowie, rozmnażanie i przetrwanie. Np. DDT spowodował drastyczne spadki populacji ptaków, np. sokola wędrownego, przez bioakumulację i cienienie skorup jaj.
Gatunki inwazyjne
Wprowadzanie gatunków obcych może zakłócić równowagę ekologiczną i zagrozić gatunkom rodzimym. Gatunki inwazyjne często mają przewagi konkurencyjne: szybkie rozmnażanie, adaptacyjność, brak naturalnych drapieżników. Mogą wyparować gatunki rodzimie, przenosić choroby, zmieniać siedliska. Wprowadzenie węża brązowego na Guam skończyło się wyginięciem lub drastycznym spadkiem kilku rodzimych gatunków ptaków i gadów.
Te czynniki mogą działać synergicznie, wzmacniając swój wpływ na bioróżnorodność. Przeciwdziałanie im przez praktyki zrównoważone, wysiłki ochronne i współpracę międzynarodową jest kluczowe dla zapobiegania przyszłym masowym wyginięciom.