Beryl może być toksyczny dla środowiska. To zanieczyszczenie trwałe, gromadzące się w glebie, wodzie i organizmach. Ekspozycja może powodować choroby płuc, problemy skórne i raka u ludzi i zwierząt.
Beryl wpada do środowiska przez działalność przemysłową, górnictwo i spalanie paliw kopalnych, i może przemieszczać się na duże odległości powietrzem i wodą. Może szkodzić roślinom, uszkadzając liście i hamując wzrost. Toksyczność zależy od formy chemicznej i drogi narażenia, a wdychanie jest najczęstsze.
Beryl to poważne zagrożenie środowiskowe, a ograniczanie narażenia na ten toksyczny metal jest ważne.