Ptaki i gady dzielą wiele cech anatomicznych i fizjologicznych. Jak wyjaśnia Muzeum Hoopera, są one bardzo podobne strukturalnie, z wyjątkiem zdolności ptaków do lotu oraz cech ułatwiających ten lot. Strona Canada's Aquatic Environments wskazuje, że ptaki wyewoluowały z gadów, co może tłumaczyć ich podobieństwa.
Kości ucha środkowego
Zgodnie z Canada's Aquatic Environments, zarówno ptaki, jak i gady posiadają tylko jedną kość ucha środkowego, podczas gdy ssaki mają ich trzy.
Jaja
Ptaki i gady składają jaja z tego samego typu błon. Młode ptaki i gady wykluwają się również z pomocą specjalnego zęba, który pomaga im przebić skorupkę jaja.
Łuk aorty
Uniwersytet Północnego Illinois informuje, że ptaki i gady mają serca z prawym łukiem aorty układowego, podczas gdy ssaki posiadają lewy łuk aorty układowego.
Szczęki
Budowa szczęków ptaków i gadów jest identyczna. Według Canada's Aquatic Environments, obie grupy mają szczęki złożone z pięciu zrostłych kości, co różni je od ssaków, których szczęki składają się z jednej kości.
Łuski
Jak podaje Uniwersytet Północnego Illinois, ptaki i gady mają łuski. U ptaków znajdują się one na nogach i łydkach, u gadów pokrywają całe ciało. Ssaki z kolei nie posiadają łusek.
Pierścienie sclerotyczne
Ptaki i gady mają podobne cechy czaszki dotyczące struktur wspierających oczy. Zgodnie z Uniwersytetem Północnego Illinois, obie grupy posiadają pierścienie sclerotyczne – pierścienie otaczające oczy i je wspierające.