Mutualizm
Mikroflora jelitowa pomaga trawić pokarm, a orzeł daje im siedlisko.
Komensalizm
Pasożyty zewnętrzne jak wesz i roztocza żyją na orle z minimalnym wpływem.
Konkurencja
Orły łysie konkurują z innymi drapieżnikami o pokarm i terytorium, promując bioróżnorodność.