Ptaki i muchy różnią się niemal we wszystkich aspektach biologicznych:
Budowa: Ptaki to kręgowce z kręgosłupem; muchy to bezkręgowce bez niego.
Rozmnażanie: Ptaki składają jaja, z których wylęgają się pisklęta w gniazdach; muchy składają jaja lub larwy w jedzeniu lub gniącącej materii organicznej.
Dieta: Ptaki od roślinożerców po mięsożercy; muchy mogą żywić się nektarem, pyłkiem lub gniącą materią organiczną.
Długość życia: Ptaki mogą żyć latami lub dekadami; muchy zazwyczaj tylko tygodniami lub miesiącami.
Siedlisko: Ptaki zalegają na niemal każdym kontynencie i w każdym ekosystemie; muchy preferują ciepłe, wilgotne klimaty.
Ewolucja: Ptaki wyewoluowały z teropodów dinozaurów; muchy należą do rzędu muchówek (Diptera).
Inteligencja: Ptaki wykazują złożone rozwiązywanie problemów i zachowania społeczne; muchy mają prymitywne uczenie się.
Komunikacja: Ptaki używają śpiewu, sygnałów wizualnych i języka ciała; muchy polegają na sygnałach chemicznych, wizualnych i dotykowych.