Babka okrągła jest ofiarą kilku gatunków ryb, w tym: troci jeziornej, łososia chinook, troci brązowej, sandacza i okonia głośnego. Ptaki – kormorany i mewy – też ją jedzą. Babki okrągłe czasem kanibalisują się nawzajem, zwłaszcze zimą, gdy pożywienia mało.