Pingwiny cesarskie stają przed wieloma zagrożeniami w antyktycznym siedlisku:
- Zmiany klimatu i utrata lodu morskiego: topnienie lodu zakłóca lęg i przeżycie piskląt.
- Zakłócenia ludzkie: badania, turystyka, żegługa dezorientują kolonie.
- Drapieżnicy: foki leopardowe, orki, ptaki drapieżne – jaja, pisklęta, dorośli.
- Dostępność pożywienia: przełowy i zmiany oceaniczne zmniejszają ryby, mienie, kryl.
- Choroby: grypa ptasia, pasożyty – szybko rozprzestrzeniają się w gęstych koloniach.
- Długie migracje: ekstremałna pogoda, wyczerpanie energii w drodze do miejsc lęgowych.
Kluczowe: hamowanie zmian klimatu, regulacja aktywności ludzkich, zrównoważone rybołówstwo.