ssaki:
* Maltańska jaszczurka ścienna: Jest to najczęściej widoczny gad na Malcie i jest endemiczny dla wyspy.
* Maltański jeż: Chociaż wprowadzony w latach siedemdziesiątych, od tego czasu stał się dobrze ugruntowany na wyspach.
* nietoperze: Malta jest domem dla kilku gatunków nietoperzy, w tym nietoperza podkowy i śródziemnomorskiej Pipistrelle.
ptaki:
* Shearwater maltański: Jest to ptak morski, który rozmnaża się na wyspach maltańskich i jest gatunkiem chronionym.
* Rock Sparrow: Wspólny ptak znaleziony na wyspach maltańskich.
* The Yelkouan Shearwater: Ten zagrożony ptak rodzi się na wyspach maltańskich i jest kluczowym celem działań ochronnych.
* Falcon Peregrine: Ten ptak drapieżny znajduje się na Malcie, chociaż jego liczba jest ograniczona.
Inne zwierzęta:
* różne gatunki ryb: Okoliczne Morze Śródziemne jest domem dla różnorodnego gatunku gatunków ryb.
* Owady: Wyspy maltańskie są domem dla szerokiej gamy gatunków owadów, w tym motyli, ćmy i chrząszczy.
Wprowadzone gatunki:
* koty: Koty domowe zostały wprowadzone do Malty i są teraz powszechnym widokiem.
* psy: Podobnie jak koty, psy zostały przywiezione na Maltę przez ludzi i znajdują się teraz na wyspach.
Warto zauważyć, że Malta jest narodem wyspowym, więc jej rodzima fauna jest ograniczona w porównaniu z krajami kontynentalnymi. Na wyspach mocno wpłynęli ludzie, co prowadzi do wprowadzenia różnych gatunków zwierząt z czasem.