Ryby-kapcie nie mają żadnych specyficznych środków ochrony. Przetrwają w głębinach morza dzięki adaptacji do skrajnego środowiska, w którym żyją, w tym wysokiego ciśnienia i niskich temperatur. Ich żelatynowe ciało i niska gęstość pomagają im wytrzymać ciśnienie i utrzymać wyporność. Są jednak wrażliwe na działalność taką jak rybołówstwo głębinowe, które może powodować spady populacji.