Zwierzęta klonowane mają ten sam układ genetyczny co ich rodzic, więc dziedziczą te same geny, które mogą predysponować je do określonych chorób. Mogą też przejmować choroby od matek zastępczych przenoszących wirusy lub bakterie.
Przykłady to:
- BSE (choroba szalonej krowy): Krowy klonowane mogą być wrażliwe nawet jeśli dawca był zdrowy.
- PRRS: Świnie klonowane mogą zachorować na tę wirusową chorobę niezależnie od statusu dawcy.
- OPP: Owce klonowane mogą być wrażliwe na tę wirusową zapalenie płuc.
Ta wrażliwość budzi obawy w rolnictwie i zdrowiu publicznym, jeśli zwierzęta klonowane trafią do łańcucha żywnościowego.