Wisconsin straciło kilka gatunków, w tym:
- Jaszczurka helbender wschodnia (Cryptobranchus alleganiensis alleganiensis): roratka uznawana za wyginiętą w regionie przez utratę siedlisk i zanieczyszczenia.
- Góral pasażer (Ectopistes migratorius): niegdyś pospolity w Wisconsin, zgładzony pod koniec XIX w. przez nadmierne polowanie i utratę siedlisk.
- Alka bezlotna (Pinguinus impennis): ptak nurkujący bezlotny, wyłowiony do wyginięcia w połowie XIX w. dla piór i mięsa.
- Kulik eskimejski (Numenius borealis): piaskowiec wyłowiony do wyginięcia pod koniec XIX w.
- Papuga karolińska (Conuropsis carolinensis): kolorowy ptak wyłowiony do wyginięcia na początku XX w.
- Puma wschodnia (Puma concolor couguar): wyginięta w regionie na początku XX w. przez polowanie i utratę siedlisk.
- Muskusowiec leśny (Symbos cavifrons): gatunek megafauny plejstocenu wyginął ok. 10 tys. lat temu.
- Bizon plejstocenu (Bison antiquus): największy znany bizon, wyginął ok. 10 tys. lat temu.
- Mastodon (Mammut americanum): ikoniczny ssak epoki lodowcowej wyginął ok. 10 tys. lat temu.
- Mamut wełnisty (Mammuthus primigenius): gatunek epoki lodowcowej wyginął ok. 10 tys. lat temu.