Ssaki endemiczne to gatunki występujące wyłącznie w określonym obszarze geograficznym, np. na danym kontynencie, w kraju, na wyspie lub w konkretnym siedlisku. Naturalnie nie występują nigdzie indziej. Przykłady to australijski koala i madagaskarski aje-aje. Te ssaki ewoluowały unikalne cechy w izolacji i stanowią kluczowy element regionalnej bioróżnorodności.