Utrata siedliska
Wycinka niszczy lasy deszczowe, sawanny, tereny podmokłe – domy jaguarów. Usuwa tereny polowań, schrony, miejsca rozmnażania.
Spadek ofiar
Zniszczenie siedlisk redukuje populacje jeleń, tapirów, pekari – jaguarze tracą bazę pożywienia.
Fragmentacja
Izolowane fragmenty lasu utrudniają migracje, parowanie, przepływ genów – wchlanianie, niższy sukces rozrodu.
Konflikt z ludźmi
Kurczące się tereny zmuszają jaguarów do zbliżania do osad – konflikty, zemstwe zabicia w obronie zwierząt hodowlanych.
Zmniejszenie zasięgu
Mniejsze tereny limitują rolę jaguarów w regulacji ofiar i rozsiewie nasion – destabilizacja całych ekosystemów.
Ułatwienie braconierstwa
Wycinka otwiera dostęp do terytoriów jaguarów dla łowców po futro, zęby, części ciała.