Utrata siedliska
Wycinka lasów pod drzewnictwo, rolnictwo i górnictwo, a także budowa dróg, fragmentują i niszczą siedlisko jaguarów.
Konflikt z ludźmi
Drapieżnictwo na zwierzętach hodowlanych prowadzi do zemsty, a nielegalne łowiectwo na futra i części ciała trwa.
Inne zagrożenia
Zmiany klimatu, choroby i zanieczyszczenia dodatkowo zagrażają jaguarom. Jako gatunki kluczowe, ich utrata zaburzyłaby ekosystemy lasów deszczowych. Ochrona: obszary chronione, zaangażowanie społeczności, antyłowictwo.