Jaguarze są zagrożoni z kilku przyczyn ludzkiego pochodzenia:
- Utrata siedliska: Lasy deszczowe, bagna i łąki wycinane pod rolnictwo, ścinanie drzew, górnictwo i rozwój infrastruktury.
- Polowanie i braconierstwo: Jaguarze zabijani za futro i w ramach odwetów za ataki na zwierzynę hodowlaną.
- Handel zwierzętami: Łapane i sprzedawane jako zwierzęta ekskluzywne lub do medycyny tradycyjnej.
- Konflikt z ludźmi: Ataki na zwierzynę prowadzą do eliminacji lub zmiany siedlisk.
- Ograniczona różnorodność genetyczna: Przeszłe wąskie gardła genetyczne czynią je wrażliwszymi na choroby i zmiany środowiska.
- Wydobywanie ofiar: Nadmierne polowanie na zwierzynę zmniejsza dostępność pożywienia.
Pilne działania ochronne są potrzebne, by chronić jaguary i ich siedliska.