„Ryby-skalniki” to wiele gatunków, więc przyczyny zagrożenia się różnią, ale czynniki wspólne to:
- Nadłowstwo: Duże zapotrzebowanie, długie życie, wolny wzrost, sieci łowiące młode – czynniki wrażliwości.
- Strata i degradacja siedliska: Rozwój przybrzeży, zanieczyszczenia, zmiany klimatyczne niszczą rafy.
- Inne czynniki: Choroby i drapieżnictwo dodatkowo stresują populacje.
Gatunki jak ryba-skalnik żółtoooczy i bocaccio były silnie przelowiwane. Działania ochronne: limity łowów, rezerwy morskie, badania.