Naturalne wrogowie żółwi morskich zależą od stadium życia.
Jaja i szczeniaki
* Na lądzie: Dzikie świnie, lisy, mapachy, psy dzike, ptaki drapieżne (kruki, jastrzębie), krable duchy.
* W wodzie: Ryby drapieżne, rekiny, krokodyle.
Dorosłe żółwie
* Duże rekiny (białoryb, tygrysi) – główną drapieżnikami dorosłych.
* Orki (wieloryby mordercze) – znane z polowania na żółwie morskie.
* Duże krokodyle.
Ludzie są największym zagrożeniem przez braconierstwo, zanieczyszczenie, utratę siedlisk i przyłów rybacki.