Choć łosoś jest pożywny, surowy łosoś może być zanieczyszczony bakteriami takimi jak Salmonella i Vibrio, a także pasożytami jak nicienie i taśmice. Mogą one wywołać zatrucia pokarmowe. Dlatego spożywanie surowego lub niedogotowanego łososia zazwyczaj nie jest zalecane. Określone gatunki łososia do sushi, poddane gwałtownemu zamrażaniu, mogą być bezpieczniejsze do spożycia surowego, ale kluczowe jest odpowiednie przechowywanie i manipulowanie. Dojrzałe upieczenie, grillowanie lub smażenie łososia to najbezpieczniejszy sposób na jego spożycie.