Akynie morskie mogą rozmnażać się zarówno bezpłciowo, jak i płciowo.
Rozmnażanie bezpłciowe
Akynie dzielą się na pół, proces zwany podziałem dwuprzedziałowym. Ciało akinii rozdziela się na dwie równe połówki, z których każda rośnie w nowego osobnika.
Rozmnażanie płciowe
Akynie uwalniają jajka i nasienie do wody. Po zapłodnieniu zigoty rozwijają się w larwy, które pływają, aż znajdą odpowiednie miejsce do osiadania i wzrostu.
Niektóre akynie są hermofrodytami jednoczesnymi (posiadają obie gony), inne – sekwencyjnymi (zmieniają płeć w trakcie życia).
Cykl rozmnażania często synchronizowany jest z cyklem księżycowym. Wiele gatunków uwalnia jajka i nasienie podczas pełni księżyca, co ułatwia spotkanie gamet i zapłodnienie.