Mikroby, znane też jako mikroorganizmy, obejmują ogromną i zróżnicowaną grupę organizmów. Poniżej najczęstsze grupy z przykładami.
Bakterie
Przykłady: Escherichia coli (E. coli), Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Salmonella, Bacillus subtilis, Lactobacillus.
Wirusy
Przykłady: wirus grypy, świnki, ospy wietrznej, rumieńca, herpes 단순, HIV (wirus niedoboru odporności ludzkiej).
Grzyby
Przykłady: Candida albicans, Aspergillus fumigatus, Cryptococcus neoformans, Tinea corporis (grzybica okrągła), Sporothrix schenckii.
Pasożyty
Przykłady: Plasmodium falciparum (pasożyt malaryczny), Entamoeba histolytica (ameba), Toxoplasma gondii, Schistosoma mansoni (krwiołat), Giardia lamblia.
Pierwotniaki
Przykłady: paramecium, Amoeba proteus, Euglena, Trypanosoma brucei (afrykańska choroba snu), Plasmodium vivax.
Ta lista to лишь mała część ogromnego świata mikrobialnego, gdyż w każdej grupie istnieje niezgłaszalna liczba gatunków i szczepów.