Pingwiny cesarskie (Aptenodytes forsteri) są wymienione jako "blisko zagrożone" (NT) przez IUCN. Populacje wydają się stabilne, ale kilka czynników przyczynia się do ich wrażliwego statusu:
Zmiany klimatyczne: Zmniejszenie lodów morskich może zakłócać cykle legowania.
Przełowienie: Wyczerpywanie zasobów rybnych wpływa na ich bazę pożywieniową.
Strata siedliska: Zanieczyszczenia, rozwój wybrzeży i aktywność ludzka degradują miejsca legowania.
Choroby i drapieżnictwo: Wprowadzone choroby i rosnące populacje drapieżników stwarzają dodatkowe ryzyko.
Wysiłki ochronne, w tym międzynarodowe ugody chroniące ekosystemy antyktyczne i programy monitoringu, są kluczowe dla ich długoterminowego przetrwania.