Zmiany klimatu: Wznoszące się morze redukuje siedliska lęgowe, zmiany prądów morskich i lodu wpływają na dostępność pożywienia.
Bezpośredni wpływ człowieka: Mewy antyktyczne bywają złowione jako przyłów w rybołówstwie, a turystyka lub górnictwo mogą zakłócać lub niszczyć miejsca lęgowe.
Gatunki inwazyjne: Wprowadzone drapieżniki (szczury, lisy) polują na jaja i pisklęta, wprowadzone rośliny zmieniają siedliska lęgowe.
Choroby: Mewy antyktyczne są podatne na cholerę ptasią i chorobę Newcastlea, rozprzestrzeniane kontaktem z innymi ptakami lub zanieczyszczonym pożywieniem/wodą.