Utrata i fragmentacja siedlisk :Naturalne siedlisko żółwi jest w coraz większym stopniu niszczone lub fragmentaryzowane w wyniku działalności człowieka, takiej jak rolnictwo, urbanizacja i górnictwo. Zmniejsza to dostępność pożywienia i miejsc gniazdowania oraz zwiększa ich podatność na drapieżniki i choroby.
Zmiany klimatyczne :Klimat w regionie, w którym żyje żółw afgański, szybko się ociepla. Powoduje to zmiany w środowisku żółwi, utrudniając im przetrwanie i rozmnażanie.
Choroba :Żółwie są również podatne na różne choroby, w tym infekcje dróg oddechowych, gnicie skorup i infekcje oczu. Choroby te mogą rozprzestrzeniać się poprzez kontakt z innymi zakażonymi zwierzętami lub przez skażoną żywność lub wodę.
Kolekcja :Żółwie są zbierane w celach handlowych, spożywczych, dla zwierząt domowych i innych, co doprowadziło do spadku ich populacji.