Muchy zładają jaja w różnych miejscach w zależności od gatunku:
- Na pokarmie lub blisko niego: Muchy domowe i owocówki kładą jaja tam, gdzie larwy mogą się żywić.
- W miejscach wilgotnych: Komary i muchy czarne kładą jaja blisko wody lub w wilgotnej glebie.
- Na zwierzętach: Muchy robakowe i muchy konne kładą jaja na zwierzętach, by larwy żywiły się krwią lub tkankami.
- W miejscach chronionych: Muchy mięsne i muchy trupojadne kładą jaja pod liśćmi lub w pęknięciach drewna.
Lokalizacja zależy od instynktu i tego, co najbardziej sprzyja przetrwawaniu larw.