Według BirdLife International, na świecie pozostaje szacunkowo od 10 000 do 45 000 afrykańskich orłów koronowanych. Czerwona Lista IUCN klasyfikuje gatunek jako „zagrożony”, co oznacza wysokie ryzyko wyginięcia w naturze z powodu utraty siedlisk, braconierstwa i polowań. Trwają działania ochronne mające na celu ratunek gatunku i jego siedlisk.