Oczy kotów najczęściej są odcieniami żółtego lub zielonego. Koty rasowe często mają głębsze zielone lub miedziane oczy. Mniej powszechne są koty z niebieskimi oczami. Choć nie ma konkretnego genu określającego kolor oczu kota, koty z pewnymi genami kolorystycznymi futra są bardziej skłonne do posiadania niebieskich oczu.
Koty z Punktami (Pointed Cats)
Koty z jasnym kolorem ciała i ciemniejszymi łapami, twarzą i ogonem nazywane są kotami „z punktami” (pointed). Koty z punktami zawsze mają niebieskie oczy. Koty syjamskie zawsze mają punkty, i to jedyna rasa, która zawsze będzie miała niebieskie oczy. W obrębie rasy istnieją wariacje koloru oczu. Np. oczy Seal Point Syjamskiego mogą być głębokim niebieskim odcieniem, podczas gdy oczy Lilac Point Syjamskiego zazwyczaj są bledszym, szarzym odcieniem niebieskiego.
Białe Koty
Koty z całkowicie białym futrem często mają niebieskie oczy. Kot z dominującymi genami białego futra może mieć niebieskie lub pomarańczowe oczy, podczas gdy kot albino może mieć niebieskie lub różowe oczy. W niektórych przypadkach całkowicie biały kot będzie miał gen białych plam (patrz poniżej), co da „oczy nietypowe” (odd eyes) – jedno niebieskie i jedno złote lub zielone.
Koty z Białymi Plamami (White Spotted Cats)
Kot z genem białych plam (tak jak „kot smokingowy”) może mieć niebieskie oczy, lub w niektórych przypadkach oczy nietypowe. Gdy gen białych plam wpływa na oba oczy, kot będzie miał niebieskie oczy; gdy gen wpływa tylko na jedno oko, kot będzie miał oczy nietypowe.
Schórzenia u Kotów z Niebieskimi Oczami
Koty z niebieskimi oczami czasem będą miały wady wzroku lub słuchu. Badanie w Vanderbilt University wykazało, że koty syjamskie często miały mniej ostry wzrok niż inne koty, co odpowiadało niższym poziomom pigmentu w kolorze oczu. Z tego powodu koty syjamskie mają tendencję do bycia mniej aktywnymi w nocy. Koty z dominującym genem białego lub genem białych plam mogą cierpieć na genetyczną głuchotę. U kota z genem białych plam, głuchota zazwyczaj występuje w uchu(ach) objętych plamami. Z tego powodu kot z oczami nietypowymi może być głuchy w uchu po tej samej stronie głowy co jego niebieskie oko.