Wielkie koty też chorują. Niektóre choroby, które dotykają małych kotów domowych, atakują też wielkie koty: lwy, ryje, pumy i rysy. W niektórych populacjach duże liczby giną z powodu chorób zakaźnych, co myśli ludzi pracujących nad ochroną już zagrożonych gatunków felinów.
Wirus upośledzenia odpornościowego kotów (FIV)
Odkryty u kotów domowych w 1975 r., FIV dotyka też wielkich kotów: rysy, pumy i ponad 80% lwów w Serengeti (Tanzania). Według Little Big Cat, FIV osłabia układ odpornościowy, czyniąc kota bardziej wrażliwym na infekcje. FIV nie ma leczenia i może prowadzić do śmierci, ale wiele wielkich kotów z wirusem żyje latami bez objawów.
Babesjoza
Choroba pasożytnicza, babesjoza infekuje wielkie koty przez kleszcze, dając objawy jak malarii. Według Big Cat Rescue, wysoce zakaźne pasożyty babesjozy odpowiadają za śmierć tygrysów w Van Vihar National Park (Bhopal, Indie). W 18 miesiącach do grudnia 2007 r. co najmniej 6 tygrysów, w tym biały tygrys, zmarło na tę chorobę.
Przewlekła choroba nerek (CKD)
Choroba dotykająca tylko wielkich kotów w niewoli, CKD często prowadzi do śmierci. Według GreenFudge.com, CKD zagraża rysom iberyjskim w centrach hodowlanych w Hiszpanii – 1 na 3 okazów wykazuje objawy. W grudniu 2009 – marcu 2010 r. CKD zabiło 3 ryje iberyjskie, które należą do najbardziej zagrożonego gatunku felinów na świecie – w naturze zostało tylko 200 sztuk.